A tese de Mestrado em Química pode ser realizada na FCUL, dotada de excelentes laboratórios de investigação que desenvolvem projetos de ponta nas principais áreas da Química, nomeadamente, Química Computacional, Síntese Química, Química Analítica, Química-Física, Eletroquímica e Química do Estado Sólido. Em geral, os projetos de dissertação são desenvolvidos nas instalações do CQE e do BioISI.